Универсальная же вакцина (стимуляция врожденного иммунитета) работает иначе и направлена на активацию врожденного иммунитета, а именно на активацию макрофагов и лимфоцитов. Механизм действия основан на активации рецепторов распознавания образов (TLR, NLR - молекулярные сенсоры, которые первыми замечают патоген или повреждение клетки и запускают сигнал тревоги), что запускает процесс эпигенетического перепрограммирования клеток. Иммунный ответ при этом широкий и антиген-независимый, что может обеспечивать защиту сразу от нескольких различных патогенов и даже от аллергенов. Результатом «обучения» врожденного иммунитета становится не выработка антител, а устойчивое изменение метаболизма и экспрессии генов макрофагов и лимфоцитов, переводя их в состояние «повышенной боевой готовности», что максимально быстро позволяет приводить к иммуному ответу (в течение часов).